Ekstrakurikuler pramuka merupakan kegiatan non-akademik yang bertujuan membentuk karakter siswa agar menjadi pribadi yang disiplin, mandiri, bertanggungjawab, serta memiliki jiwa kepemimpinan dan semangat kebersamaan. Melalui kegiatan ini, siswa juga dilatih untuk mencintai alam, berjiwa sosial, dan siap menghadapi berbagai tantangan.
Adapun beberapa kegiatan dalam ekstrakurikuler pramuka di Madrasah Tsanawiyah Negeri 1 Purbalingga adalah Kemah Penerimaan Anggota Baru setiap awal tahun ajaran baru bagi siswa baru kelas 7, baris-berbaris, keterampilan tali-temali atau pionering, sandi dan isyarat, penjelajahan atau hiking, kegiatan sosial. Selain itu siswa juga diajarkan nilai-nilai kepramukaan seperti kerjasama tim, tolong menolong, dan kedispilinan dalam kehidupan sehari-hari.
Ekstrakurikuler Pramuka juga ikut aktif dalam kegiatan diluar mulai dari kegiatan yang diselenggarakan oleh tingkat Kwartir Ranting Karanganyar, Kwartir Cabang Purbalingga maupun tingkat Kwartir Daerah Jawa Tengah.